El Área de Proyectos de la UPCEF tiene como funciones principales las siguientes:

a)      Desarrollar actividades relacionadas a la gestión y administración de recursos obtenidos de la cooperación externa

b)      Definir y coordinar con las Unidades Ejecutoras, los criterios de operación de los proyectos específicos de desarrollo rural, en el marco de las políticas sectoriales

c)      Propiciar la gestión y administración eficiente y eficaz de los mecanismos de cooperación técnica y financiera externa, vinculadas al Ministerio

d)      Planificar en el marco de las políticas sectoriales, las acciones inherentes a la coordinación de proyectos

e)      Representar al MAGA en los foros vinculados con su ámbito de acción de proyectos

f)        Realizar las demás funciones que indique el Despacho Ministerial y sean de su competencia

El Área de Cooperación Externa de la UPCEF tiene como funciones principales las siguientes:

1. Realizar las actividades de gestión de recursos para financiar proyectos del MAGA como ente ejecutor
2. Establecer mecanismos de cooperación técnica y financiera con organizaciones nacionales e internacionales, vinculadas a procesos de desarrollo productivo
3. Crear mecanismos e instrumentos metodológicos que permitan viabilizar el impulso y aplicación de las políticas del sector
4. Participar en la selección y adjudicación financiera a los proyectos productivos, tipificados como elegibles, en función de las políticas definidas por el MAGA
5. Velar por la adecuada utilización de los recursos en el proceso de ejecución, operación y recuperación de aquellos fondos destinados para el desarrollo de proyectos priorizados
6. Dar el seguimiento al desarrollo de actividades y al impacto provocado por la ejecución de proyectos financiados a través de la cooperación financiera externa
7. Diseñar y aplicar un sistema de seguimiento y evaluación concertado y uniforme que permita informar periódicamente a las instancias respectivas, del avance físico y/o financiero de los proyectos ejecutados a través de la cooperación externa
8. Otras actividades inherentes al Área y que sean asignadas por el Coordinador de la UPCEF

El Área de Fideicomisos de la UPCEF tiene como funciones principales las siguientes:

1. Coordinar las modificaciones y ampliaciones a las escrituras de constitución y de los reglamentos de cada fideicomiso con el fiduciario correspondiente
2. Velar por la administración de los fideicomisos de conformidad con los contratos correspondientes
3. Presentar propuestas de inversión en función de los lineamientos de las escrituras de cada fideicomiso y su correspondiente reglamentación
4. Otras actividades inherentes al Área y que sean asignadas por el Coordinador de la UPCEF